das kann verschiedene Ursachen haben, eine Ferndiagnose zu stellen ist super schwer.
Ich kann Dir nur den Tip geben mal die aktuellen Mainboardtreiber (VIA, NVIDIA ???) zu installiren da es möglich ist das SP4 irgendwelchen Windows Standartreiber rübergezogen hat welche das System bremsen. Check auh mal ob die Festplatten mit voller UDMA Geschwindigkeit laufen (im Gerätemanager auf Laufwerkscontroller).